Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM221AA4D161 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms