Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GRIK4Q16099 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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