Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NCOA4Q13772 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCOA4Q13772 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NCOA4Q13772 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms