Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RIGQ13278 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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RIGQ13278 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RIGQ13278 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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