Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RN7SL870P-201ENST00000460111 296 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 GABRP-201ENST00000265294 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LY75-CD302-202ENST00000505052 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD11P31277 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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