Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PTPREP23469 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PTPREP23469 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPREP23469 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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