Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TRPM3-212ENST00000396283 3484 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CACNB1Q02641 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms