Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC74AQ96AQ1 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CCDC74AQ96AQ1 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CCDC74AQ96AQ1 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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