Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GLIS3Q8NEA6 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms