Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN4PQ13434 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms