Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CLN3Q13286 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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