Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF3Q13114 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms