Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ECM1Q16610 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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