Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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