Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNCBQ16143 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SNCBQ16143 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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