Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SF3B2Q13435 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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