Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPRNQ16849 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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PTPRNQ16849 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PTPRNQ16849 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRNQ16849 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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