Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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GPM6BQ13491 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GPM6BQ13491 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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