Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SMARCB1Q12824 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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SMARCB1Q12824 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SMARCB1Q12824 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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