Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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PGGT1BP53609 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP53609 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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