Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 FHL1-206ENST00000394153 2374 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC026336.5-201ENST00000624455 738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 OR8G1-202ENST00000641972 5055 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
HOXD11P31277 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
HOXD11P31277 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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