Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
HOXD10P28358 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HOXD10P28358 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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