Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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HCN4Q9Y3Q4 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HCN4Q9Y3Q4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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