Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NHLRC3-201ENST00000379599 3275 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RETREG1-202ENST00000399793 3145 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDK2-201ENST00000392650 10723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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