Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1CQ15572 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms