Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
MTMR3Q13615 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms