Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NEUROD1Q13562 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NEUROD1Q13562 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms