Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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FOXC1Q12948 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
FOXC1Q12948 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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