Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
GRIK4Q16099 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms