Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms