Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CKAP5Q14008 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms