Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CUL3Q13618 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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