Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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TUBB3Q13509 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
TUBB3Q13509 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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