Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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MKRN4PQ13434 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
MKRN4PQ13434 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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