Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N7

ROBO1, Roundabout homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO1Q9Y6N7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ROBO1Q9Y6N7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ROBO1Q9Y6N7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms