Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SNX9Q9Y5X1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX9Q9Y5X1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms