Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFE2L3Q9Y4A8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms