Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9Y3F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9Y3F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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