Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms