Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms