Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THSD7AQ9UPZ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
THSD7AQ9UPZ6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms