Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAK1Q9UPV9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAK1Q9UPV9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms