Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms