Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FZD1Q9UP38 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms