Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PNMA3Q9UL41 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms