Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA11Q9UKX5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms