Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN3Q9UKS6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms