Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP8AP2Q9UKL3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms