Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GGA1Q9UJY5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GGA1Q9UJY5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms