Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSKSQ9UJT2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSKSQ9UJT2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms